如今最紧要的，当然就是防止疫病的发生和蔓延。所以子轩就下令将各州县的郎中药铺等统一管理，分派到各个地方，给百姓看病。同时，封锁那几处受灾严重的州县，不允许百姓再往外逃荒，而是留在当地，由各地的兵士帮着重建家园。
同时，还跟这些人讲了一些疫病预防的事情，例如必须喝烧开的水，不能喝生水。难民集中的地方，要统一建厕所，不允许随地便溺。厕所要有专门的人打扫，每天都撒上石灰。难民集中的地方，也要撒上石灰。另外让那些大夫给配一些杀蚊子和苍蝇的药，每晚都在难民集中的地方点燃，熏死苍蝇和蚊子，这样就可以防止蚊虫叮咬儿引起疫病的转播。