相传女娲造人时，遗留多了一块渣土，被弃置在蛮荒之中，历经数万年，陆地沉沦成了一片汪洋大海，那渣土逐渐化为玉石。
又不知几万年，那地方露出海面变成高山。因那玉石出于女娲之手，沾了仙气，又长年累月吸收日月之光，已经成了仙胞。
它所在的山峰终日祥霞彩雾，清幽安静。于是定名为“清灵山”，设一座道观。观主是位白发苍苍的太乙散仙，属于地仙一类，俗称“云来祖师”。
一日，云来祖师正在向徒弟们授业，听到一阵悠悠之声，似箫非箫，似笛非笛，于是用手在前面虚空处一抹，山中情景立刻显现，原来有一只巨大的穿山甲钻入了山里，盗窃了玉石，正背着往外飞奔。
云来祖师一挥拂尘，顿时千丝万缕直卷入山中，一下缠着穿山甲，把它拖了出来，“隆”一声，倒在众人面前，那块晶莹剔透的玉石也滚下了地面，在众人惊愕间，“砰”的爆开，石硝飞溅，从中跳出一个精灵，像三岁小孩，身穿银甲，双眼如电，束发的头巾上挂着三颗明珠，蹦蹦跳跳非常灵活。
云来祖师收之为徒，暂以“石精灵”称呼，授以道学秘术。
石精灵开始懂人事，会说话，闲来常替祖师煮茶炼药，而且深得门人喜爱。
道观里十分宽阔，有奇花异木、瑶池碧瓦，有幽静的坐禅堂和藏经阁，也有热闹非凡的练武场。石精灵天天钻出钻入，其乐融融，浑然不觉时日变迁。
这天，他跟随云来祖师入深山采药，同行的还有师兄丹宝、丹贝，而丹青、丹生和丹舟则负责守卫清灵道观。那几位都是云来祖师的嫡传弟子，年纪虽小，实力却不容忽视，所以，云来祖师非常放心，拂尘一挥，带着三徒腾云而去。
须臾，来到一处雾霾弥漫的大山谷，隐隐听到乌鸦长鸣、狼嚎鬼叫，四周古木苍苍，怪石嶙峋。树丛间长满了巨大的蘑菇，有的足足比常人高大数倍，花花绿绿的，散发着阵阵诡异的清香。又见一些奇花异草竟会自行舞蹈，眼看有成妖变精的趋势。
云来祖师警告徒弟们，千万别招惹这些怪异的东西。石精灵口头答应了，可是心里好奇，忍不住偷偷地拔了一株会动的小草藏在怀里。
进了深谷底，只见一条清澈流淌的小溪里有许多长着艳丽翅膀的小鱼，鼓起大眼睛跳上水面，在空中“吱吱嘎嘎”的叫，然后嘴巴涨大，喷出黑色的毒液，像箭一样直射过来。
云来祖师眉头一皱，手挥拂尘，在三徒儿身布下了一道光影，算是防御网。毒液被隔阻，在防御网上迅速升起大阵的黑烟，原来毒液具有极强的腐蚀性，若非云来祖师道法高强，只怕支撑不了片刻。
那些怪鱼毕竟属于水中之物，不能长时间停留空中，眼见攻击无效，纷纷钻入水里，转瞬间消失得无影无踪。
石精灵指着左边，惊慌失措地道：“师傅，看那边！”
原来在溪水的上头有一条蟒蛇，蛇身比普通的水桶还粗，正竖起头盯着他们，碧绿的巨眸闪烁着诡异的光芒，一看就知道是上古遗留的品种，肯定存活了数百年，属于略懂修行的蛇妖。它竖起尾巴，足足有三丈高，夹着可怕的呼啸声，直朝四人所站的地方打落。
云来祖师带着三徒飘出数丈，轻描淡写地避其锋芒，接着随手一掌拍出，只见一股深白色的掌影如雷电吐信，瞬间击中蛇身，一声爆响，蛇鳞满天散落，流出墨绿的血液。巨蟒嘶叫着撞向山石间，激起大阵的尘埃，看来已负重伤。
云来祖师这一掌力道极猛，还好，没有打它的头部，否则一招毙命。
巨蟒翻滚着身体，十分忌惮地盯着云来祖师，修为高者，无形中会散发出一股逼迫的气势，它似乎衡量了一会，终于还是把头缩了回去，扭动身子，钻入了旁边的大石洞里。
丹宝问：“师傅，我们要找的到底是什么草药？”
“千年木莲，”云来祖师抚须一笑，“只是这木莲生长在深山里，得来不易，恐怕有怪兽看护。待会我来应付怪兽，你们三个想办法摘取木莲。”
三徒儿点头答应。
走到深谷尽头，只见前面立着一块巨石，写着“大望谷漕石洞”几个大红字，旁边是一扇紧闭的石门，隐隐冒出青烟，阴森恐怖，显然是妖精老窝。
石精灵并不知道妖精为何物，脸上充满了好奇之色。但丹宝和丹贝却唬得浑身颤抖，本以为是山中猛兽罢了，哪知道竟有妖精！连云来祖师也暗暗纳闷，他法力高强，在清灵道观时，已用“神来之影”窥探过，发现千年木莲就在这附近，现在估计被妖精霸占了，料想这妖精的妖法不弱，若非如此，他不可能探不出来。
那道石门忽然“隆隆”的打开，冲出一群小妖，吖吖地吆喝着，有狐狸头人身，也有人头牛身或半狼半人，奇形怪状，不能尽说。最后，只见一个身高三丈的妖魔慢慢地走了出来，竟然是个狮头人身的家伙，披着一副金甲，右手握着一支足足有四丈长的钢矛，矛头银光闪闪，显然是件难得的神兵利器。
“是谁擅入我的地盘？”狮妖喝声如，震得四下回音不绝。
云来祖师淡定一笑，道：“老朽乃清灵道观的云来，不知此处是你的地盘，只为千年木莲而来，如果你知其下落，万望相告，老朽自然有件法宝与你交换，不知阁下意下如何？”
“哦？是什么法宝，拿出来瞧瞧，让我开开眼界！